تأسس قسم الكيمياء مع بداية تأسيس جامعة النجاح الوطنية في عام 1977، ويقدم القسم خمسة برامج دراسية، وهي بكالوريوس في الكيمياء البحتة، بكالوريوس في الكيمياء التطبيقية، يكالوريوس تخصص رئيسي كيمياء تخصص فرعي تربية، ماجستير في الكيمياء، دكتوراه في الكيمياء.

وتهدف البرامج التي يطرحها القسم الى رفد المجتمع الفلسطيني بالكفاءات العلمية المتخصصة اللازمة لخدمته في وضع برامج وخطط التنمية والتعليم والصناعة وإجراء البحوث العلمية الأكاديمية والتطبيقية والمساهمة في نشر الثقافة العلمية وتقديم الخدمات الفنية في مجال الكيمياء التطبيقية للقطاعين الحكومي والخاص. وكذلك إعداد جيل من الخريجين للمساهمة في بناء مجتمع قادر على المنافسة واعداد كادر من المتخصصين في مجال الكيمياء للارتقاء بالمجتمع في مجالات التعليم والبحث العلمي  وحل المشكلات العلمية والصناعية التي تواجه خطط التنمية في فلسطين، والوصول الى مستوى أداء تعليمي متميز يؤهل الخريج لتدريس مادة الكيمياء في المدارس الحكومية والخاصة مع مراعاة استخدام طرق التدريس الحديثة في التعلم والتعليم والمساهمة في بناء مجتمع معرفي من خلال اعداد كادر من الخريجين القادرين على تدريس مختلف مواضيع الكيمياء في المدارس الحكومية والخاصة باستخدام اساليب حديثة في التعلم والتعليم سواء نظريا أو مخبريا.

وقد اتخذ قسم الكيمياء رؤية شمولية وطموحة تمكن الخريجين من لعب دور قيادي في مستقبلهم المهني سواء القطاع الخاص أو العام.  ويتم تسليح الخريجين بخطط دراسة غنية ومتنوعة مما يمكن الطالب العمل في مجالات متعددة. هذا وتتم دراسة تطوير خطة البرنامج بما يتلاءم مع تطورات العلوم والتكنولوجيا وحاجة المجتمع المحلي من أجل نيل التنمية المستدامة.